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PangenomeTIGR4
serotype 4
D39
serotype 2
D39V
serotype 2
Hungary19A-6
serotype 19A
EF3030
serotype 19F
670-6B
serotype 6B
6A-10
serotype 6A
70585
serotype 5
A026
serotype 19F
A66
serotype 3
AP200
serotype 11A
ASP0581
serotype 12F
ATCC 49619
serotype 19F
ATCC 700669
serotype 23F
BM6001
serotype 19F
BVJ1JL
serotype 1
CGSP14
serotype 14
G54
serotype 19F
HU-OH
serotype 3
Hu15
serotype 19A
Hu17
serotype 19A
INV104
serotype 1
INV200
serotype 14
JJA
serotype 14
MDRSPN001
serotype 19F
NCTC7465
serotype 1
NCTC7466
serotype 2
NU83127
serotype 4
OXC141
serotype 3
P1031
serotype 1
R6
serotype 2
SP49
serotype 19A
SPN032672
serotype 1
SPN034156
serotype 3
SPN034183
serotype 3
SPN994038
serotype 3
SPN994039
serotype 3
SPNA45
serotype 3
ST556
serotype 19F
TCH8431/19A
serotype 19A
Taiwan19F-14
serotype 19F
Xen35
serotype 4
gamPNI0373
serotype 1

NCBI: 24-APR-2025

Summary[edit | edit source]

  • organism: Streptococcus pneumoniae Hungary19A-6
  • locus tag: SPH_RS12835 [old locus tag: SPH_1885 ]
  • pan locus tag?: PNEUPAN003231000
  • symbol: SPH_RS12835
  • pan gene symbol?:
  • synonym:
  • product: accessory Sec-dependent serine-rich glycoprotein adhesin

Genome View[edit | edit source]

Gene[edit | edit source]

General[edit | edit source]

  • type: CDS
  • locus tag: SPH_RS12835 [old locus tag: SPH_1885 ]
  • symbol: SPH_RS12835
  • product: accessory Sec-dependent serine-rich glycoprotein adhesin
  • replicon: chromosome
  • strand: -
  • coordinates: 1745650..1760100
  • length: 14451
  • essential: unknown

Accession numbers[edit | edit source]

  • Location: NC_010380 (1745650..1760100) NCBI
  • BioCyc: SPH_RS12835 BioCyc
  • MicrobesOnline: see SPH_1885
  • PneumoBrowse for strain D39V:

Phenotype[edit | edit source]

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DNA sequence[edit | edit source]

  • 1
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    GCCTCAGCAAGTACTAGTGCATCAGCTTCAGCATCAACCAGTGCGTCAGCCTCAGCATCA
    ACGAGTGCGTCAGCTTCAGCATCAACAAGTGCGTCAGCTTCAGCATCAACCAGTGCGTCA
    GCCTCAGCAAGTACTAGCGCCTCAGCATCAGCGTCAACAAGTACTAGCGCCTCAGCCTCA
    ACCAGTGCCTCAGCCTCAGCAAGTACCTCAGCGTCTGAATCAGCATCAACAAGTGCCTCG
    GCTTCCGCATCAACGAGTGCATCAGCTTCAGCATCAACAAGTGCCTCAGCTTCAGCAAGT
    ACCAGTGCGTCGGCTTCAGCATCAACGAGTGCTTCAGTCTCAGCGTCAACCAGTGCCTCT
    GAATCCGCATCAACCAGTGCCTCGGCTTCAGCAAGCACCAGTGCGTCGGCTTCAGCAAGT
    ACTAGCGCCTCAGCATCAGCGTCAACCAGTGCCTCGGCCTCAGCATCAACCAGTGCCTCA
    GCTTCAGCGTCAACGAGTGCTTCGGCTTCAGCAAGTACCAGTGCTTCGGCCTCAGCATCG
    ACAAGCGCCTCGGCCTCAGCGTCAACCAGTGCCTCTGAATCGGCATCAACCAGTGCTTCA
    GCCTCAGCGTCGACAAGTGCGTCAGCTTCAGCATCAACAAGTGCGTCAGCTTCAGCATCA
    ACCAGTGCCTCAGCTTCGGCCTCAACAAGTGCGTCAGCTTCAGCAAGCACCAGTGCTTCG
    GCTTCAGCGTCGACAAGTGCGTCAGCCTCAGCAAGCACAAGCGCCTCAGCTTCAGCATCA
    ACAAGTGCGTCGGCCTCAGCAAGTACAAGCGCCTCAGCCTCAGCAAGCACAAGTGCATCA
    GCCTCAGCAAGCACCAGTGCTTCAGCTTCAGCAAGCACCTCAGCGTCTGAGTCAGCCTCA
    GCAAGCACATCAGCTTCTGAATCTGCCTCAACAAGTGCGTCAGCCTCAGCATCGACAAGC
    GCCTCGGCTTCCGCAAGTACCAGTGCTTCGGCCTCAGCAAGTACCTCAGCGTCTGAATCG
    GCCTCAACAAGTGCGTCAGCCTCAGCAAGCACATCAGCTTCTGAATCGGCATCGACAAGT
    GCGTCAGCTTCAGCGTCAACCAGTGCGTCGGCCTCAGCAAGTACTAGTGCCTCGGCTTCA
    GTAAGTACCAGTGCTTCGGCTTCAGCAAGCACAAGTGCCTCAGTTTCAGCATCAACCAGT
    GCTTCGGCTTCAGCGTCAACGAGCGCCTCAGCTTCAGCAAGCACATCAGCTTCTGAATCT
    GCATCAACCAGTGCTTCAGCCTCAGCGTCGACAAGTGCTTCGGCTTCAGCAAGTACCTCA
    GCGTCTGAATCAGCATCAACAAGTGCATCGGCTTCAGCATCAACGAGTGCATCAGCTTCA
    GCATCAACAAGTGCATCAGCTTCAGCAAGTACCAGTGCGTCGGCTTCAGCATCAACGAGT
    GCTTCAGTCTCAGCGTCAACCAGTGCCTCTGAATCCGCATCAACAAGTGCCTCGGCTTCA
    GCAAGCACCAGTGCGTCGGCTTCAGCAAGTACTAGTGCTTCAGCTTCAGCAAGTACTAGC
    GCCTCAGCATCAGCGTCAACAAGTGCTTCGGCTTCAGCGTCAACGAGTGCGTCTGAGTCA
    GCATCAACGAGTGCGTCAGCCTCAGCAAGTACTAGTGCATCAGCTTCAGCAAGTACTAGC
    GCCTCAGCCTCAGCATCAACAAGTGCTTCAGTCTCAGCGTCAACCAGTGCCTCTGAATCC
    GCATCAACGAGTGCATCAGCTTCAGCAAGCACATCAGCATCTGAATCAGCGTCAACCAGT
    GCCTCTGAATCCGCATCAACCAGTGCATCGGCTTCAGCAAGCACCAGTGCCTCAGCTTCA
    GCATCAACAAGTGCATCAGCTTCAGCATCGACAAGCGCCTCAGCTTCAGCAAGTACCAGT
    GCGTCAGCCTCAGCAAGTACCAGTGCTTCAGCCTCAGCATCAACAAGTGCATCAGCTTCA
    GCAAGCACCAGTGCGTCGGCCTCAGCAAGCACCAGTGCTTCGGATTCAGCGTCAACCAGT
    GCATCAGCTTCAGCATCAACGAGTGCATCGGCTTCAGCGTCAACCAGTGCATCAGTCTCA
    GCAAGCACCAGTGCGTCGGCTTCAGCAAGTACTAGCGCCTCAGCCTCAACCAGTGCATCA
    GCCTCAGCAAGTACTAGTGCATCAGCTTCAGCCTCAACGAGTGCATCAGCCTCAGCAAGT
    ACCTCAGCGTCTGAATCAGCATCAACAAGTGCCTCGGCTTCAGCATCAACGAGTGCGTCA
    GCCTCAGCAAGTACTAGTGCATCAGCTTCAGCATCAACGAGTGCATCGGCTTCAGCGTCA
    ACCAGTGCATCAGAGTCAGCAAGTACCAGTGCGTCAGCTTCCGCATCAACAAGTGCATCG
    GCTTCAGCAAGCACCAGTGCCTCAGCTTCAGCATCAACAAGTGCATCAGCTTCAGCAAGT
    ACCAGTGCGTCGGCTTCAGCATCAACCAGTGCGTCAGCCTCAGCATCAACGAGTGCGTCA
    GCTTCAGCATCAACAAGTGCGTCAGCTTCAGCATCAACCAGTGCGTCAGCCTCAGCAAGT
    ACTAGCGCCTCAGCATCAGCGTCAACAAGTACTAGCGCCTCAGCCTCAACCAGTGCCTCA
    GCCTCAGCAAGTACCTCAGCGTCTGAATCAGCATCAACAAGTGCCTCGGCTTCCGCATCA
    ACGAGTGCATCAGCTTCAGCATCAACAAGTGCCTCAGCTTCAGCAAGTACCAGTGCGTCG
    GCTTCAGCATCAACGAGTGCTTCAGTCTCAGCGTCAACCAGTGCCTCTGAATCCGCATCA
    ACCAGTGCCTCGGCTTCAGCAAGCACCAGTGCGTCGGCTTCAGCAAGTACTAGCGCCTCA
    GCATCAGCGTCAACCAGTGCCTCGGCCTCAGCATCAACCAGTGCCTCAGCTTCAGCGTCA
    ACGAGTGCTTCGGCTTCAGCAAGTACCAGTGCTTCGGCCTCAGCATCGACAAGCGCCTCG
    GCCTCAGCGTCAACCAGTGCCTCTGAATCGGCATCAACCAGTGCTTCAGCCTCAGCGTCG
    ACAAGTGCGTCAGCTTCAGCATCAACAAGTGCGTCAGCTTCAGCATCAACCAGTGCCTCA
    GCTTCGGCCTCAACAAGTGCGTCAGCTTCAGCAAGCACCAGTGCTTCGGCTTCAGCGTCG
    ACAAGTGCGTCAGCCTCAGCAAGCACAAGCGCCTCAGCTTCAGCATCAACAAGTGCGTCG
    GCCTCAGCAAGTACAAGCGCCTCAGCCTCAGCAAGCACAAGTGCATCAGCCTCAGCAAGC
    ACCAGTGCTTCAGCTTCAGCAAGCACCTCAGCGTCTGAGTCAGCCTCAGCAAGCACATCA
    GCTTCTGAATCTGCCTCAACAAGTGCGTCAGCCTCAGCATCGACAAGCGCCTCGGCTTCC
    GCAAGTACCAGTGCTTCGGCCTCAGCAAGTACCTCAGCGTCTGAATCGGCCTCAACAAGT
    GCGTCAGCCTCAGCAAGCACATCAGCTTCTGAATCGGCATCGACAAGTGCGTCAGCTTCA
    GCGTCAACCAGTGCGTCGGCCTCAGCAAGTACTAGTGCCTCGGCTTCAGTAAGTACCAGT
    GCTTCGGCTTCAGCAAGCACAAGTGCCTCAGTTTCAGCATCAACCAGTGCTTCGGCTTCA
    GCGTCAACGAGCGCCTCAGCTTCAGCAAGCACATCAGCTTCTGAATCTGCATCAACCAGT
    GCTTCAGCCTCAGCGTCGACAAGTGCTTCGGCTTCAGCAAGTACCTCAGCGTCTGAATCA
    GCATCAACAAGTGCATCGGCTTCAGCATCAACGAGTGCATCAGCTTCAGCATCAACAAGT
    GCATCAGCTTCAGCAAGTACCAGTGCGTCGGCTTCAGCATCAACGAGTGCTTCAGTCTCA
    GCGTCAACCAGTGCCTCTGAATCCGCATCAACAAGTGCCTCGGCTTCAGCAAGCACCAGT
    GCGTCGGCTTCAGCAAGTACTAGTGCTTCAGCTTCAGCAAGTACTAGCGCCTCAGCATCA
    GCGTCAACAAGTGCTTCGGCTTCAGCGTCAACGAGTGCGTCTGAGTCAGCATCAACGAGT
    GCGTCAGCCTCAGCAAGTACTAGTGCATCAGCTTCAGCATCAACGAGTGCATCGGCTTCA
    GCGTCAACCAGTGCATCAGAGTCAGCAAGTACCAGTGCGTCAGCTTCCGCATCAACAAGT
    GCATCGGCTTCAGCAAGCACCAGTGCGTCGGCTTCAGCAAGTACTAGCGCCTCAGCTTCA
    GCAAGCACAAGCGCCTCAGCTTCAGCATCAACGAGTGCGTCAGCTTCAGCATCAACGAGT
    GCGTCAGCTTTAGCATCAACGAGTGCCTCTGAATCGGCATCAACAAGTGCTTCAGCCTCA
    GCATCGACAAGCGCCTCAGCCTCAGCATCGACAAGTGCCTCGGCTTCAGCATCAACGAGT
    GCTTCGGCTTCAGCATCGACAAGCGCTTCAGCCTCAGCATCAACAAGTGCATCAGCTTCA
    GCAAGCACCAGTGCGTCGGCCTCAGCAAGTACCAGTGCCTCAGCTTCGGCATCAACCAGC
    GCCTCGGCCTCAGCAAGCACCTCAGCATCTGAATCCGCATCAACGAGTGCATCAGCTTCT
    GAATCGGCCTCAACAAGTGCCTCGGCCTCAGCAAGCACAAGCGCCTCAGCCTCAGCATCA
    ACAAGTGCATCAGCTTCCGCATCAACGAGTGCTTCGGCTTCAGCCTCAACGAGTGCCTCA
    GCTTCAGCGTCAACCAGTGCTTCGGCCTCAGCATCGACAAGTGTCTCAGCTTCAGCAAGT
    ACTAGCGCCTCAGCCTCAGCATCAACAAGTGCCTCGGCTTCAGCAAGTACTAGCGCCTCA
    GCCTCAGCATCAACCAGTGCGTCAGCTTCAGCAAGTACATCAGTTTCAAATTCAGCAAAC
    CATTCGAACTCACAAGTTGGAAATGCTTCTGGATCGACAGGTAAATCCCAAAAAGAATTG
    CCTAATACAGGTACTGAGTCGTCAATTGGATCTGTGTTACTTGGAGTTCTAGCAGCTGTT
    ACAGGTATTGGATTGGTTGCGAAACGCCGTAAACGTGATGAAGAAGAGTAA
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    14220
    14280
    14340
    14400
    14451

Protein[edit | edit source]

General[edit | edit source]

  • locus tag: SPH_RS12835 [old locus tag: SPH_1885 ]
  • symbol: SPH_RS12835
  • description: accessory Sec-dependent serine-rich glycoprotein adhesin
  • length: 4816
  • theoretical pI: 4.04038
  • theoretical MW: 417021
  • GRAVY: 0.0459925

Function[edit | edit source]

  • TIGRFAM:
    serine-rich repeat adhesion glycoprotein (TIGR04224; HMM-score: 67.9)
    and 2 more
    Cell structure Cell envelope Other LPXTG cell wall anchor domain (TIGR01167; HMM-score: 30.5)
    KxYKxGKxW signal peptide (TIGR03715; HMM-score: 28.8)
  • TheSEED:
  • PFAM:
    no clan defined Gram_pos_anchor; LPXTG cell wall anchor motif (PF00746; HMM-score: 50)
    and 1 more
    KxYKxGKxW_sig; KxYKxGKxW signal peptide (PF19258; HMM-score: 34.6)

Structure, modifications & cofactors[edit | edit source]

  • domains:
  • modifications:
  • cofactors:
  • effectors:

Localization[edit | edit source]

  • PSORTb: Cellwall
    • Cytoplasmic Score: 0.01
    • Cytoplasmic Membrane Score: 0.01
    • Cellwall Score: 9.97
    • Extracellular Score: 0.01
    • Internal Helices: 2
  • DeepLocPro: Cell wall & surface
    • Cytoplasmic Score: 0.0017
    • Cytoplasmic Membrane Score: 0.0017
    • Cell wall & surface Score: 0.9111
    • Extracellular Score: 0.0854
  • SignalP: no predicted signal peptide
    • SP(Sec/SPI): 0.033294
    • TAT(Tat/SPI): 0.007117
    • LIPO(Sec/SPII): 0.002847
  • predicted transmembrane helices (TMHMM): 1

Accession numbers[edit | edit source]

Protein sequence[edit | edit source]

  • MFFRRQKGEYRETDRVTRFKLIKSGKHWLRASTSLFGLFKVLRGGVDTTQVMTETVEDKVSHSITGLDILKGIVAAGTVISGTVATQTKVFTNESAVLEKTVEKTDALATNGTVVLGTISTSNSASSTSLSASESASTSASESASTSASTSASTSASESASTSASTSISASSTVVGSQTAAATEATAKKVEEDRKKPASDYAASVTNVNLQSYAKRRKRSVDSIEQLLASIKAAVFSGNTIVNGAPVINASLNIAKSETKVYTGKGVDSVYNVPIYYQLKVTNDGSKLTFTYTVTYVNPNTRALENLSRMSYRYSIYNAGTSTQTMLTLGRGLGKPSVVKNYITDKDGRQVRYYNTSTMTKRGSGYTWANGAQMNGWYAKKEYGLTSSWTVPITGTDTSFTFTPYAAKTDRIGINYFKGRGKVVESSTTSQSLSQSKSLSVSASQSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASVSTSASASASTSASVSASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASVSASTSASESASTSASASASTSASDSASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASASASTSASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSTSASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASVSTSASASASTSASVSASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASESASTSASASASTSASESASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASDSASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASASASTSASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSTSASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASVSTSASASASTSASVSASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASVSASTSASESASTSASASASTSASESASTSASVSASTSASESASTSASASASTSASDSASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASASASTSASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASVSTSASASASTSASVSASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSTSASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASVSTSASASASTSASVSASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASESASTSASASASTSASESASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASDSASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASASASTSASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSTSASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASVSTSASASASTSASVSASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASALASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSVSASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSVSNSANHSNSQVGNASGSTGKSQKELPNTGTESSIGSVLLGVLAAVTGIGLVAKRRKRDEEE

Experimental data[edit | edit source]

  • protein localization:
  • interaction partners:

Expression & Regulation[edit | edit source]

Operon[edit | edit source]

Regulation[edit | edit source]

  • regulator:

Transcription[edit | edit source]

  • transcription start site:

Expression data[edit | edit source]

  • PneumoExpress for strain D39V:

Biological Material[edit | edit source]

Mutants[edit | edit source]

Expression vector[edit | edit source]

lacZ fusion[edit | edit source]

GFP fusion[edit | edit source]

two-hybrid system[edit | edit source]

FLAG-tag construct[edit | edit source]

Antibody[edit | edit source]

Other Information[edit | edit source]

You can add further information about the gene and protein here. [edit]

Literature[edit | edit source]

References[edit | edit source]

Relevant publications[edit | edit source]